Doktorand:in im Bereich Pflanzenwissenschaften / Transkriptomanalysen (w/m/d)

Forschung für eine Gesell­schaft im Wandel: Das ist unser Antrieb im For­schungs­zen­trum Jülich. Als Mitglied der Helmholtz-Gemein­schaft stellen wir uns großen gesell­schaft­lichen Heraus­forde­rungen unserer Zeit und erfor­schen Optionen für die digi­tali­sierte Gesell­schaft, ein klima­schonendes Energie­system und res­sour­cen­schüt­zendes Wirt­schaften. Arbeiten Sie gemein­sam mit rund 7.400 Kolleg:innen in einem der größten For­schungs­zen­tren Europas und gestalten Sie den Wandel mit uns!

Sie möchten durch Ihre Arbeit einen Beitrag zur nach­haltigen Pflanzen­nutzung leisten? Dann sind Sie am Instituts­bereich Bioinformatik (IBG-4) des Instituts für Bio- und Geo­wissen­schaften am Forschungs­zentrum Jülich genau richtig. Der Instituts­bereich bearbeitet und entwickelt Methoden und Algorithmen, um ein grund­legendes Verständnis insbesondere von hoch­dimensionalen Daten und Prozessen in der Bioökonomie zu erzielen. Das Team konzentriert sich auf Wissens­management und Daten­integration, klassische Bio­informatik und maschinelles Lernen, insbesondere für die Vorhersage von Phänotypen zu biologischen Fragen, die die trans­kriptionelle Umprogrammierung von Pflanzen während der abiotischen Stress­antwort, die Identifizierung von Stoff­wechsel­wegen für sekundäre Metaboliten und das Verständnis der pflanzlichen Zell­wand­biosynthese betreffen.

Verstärken Sie uns zum nächst­möglichen Zeitpunkt als

Doktorand:in im Bereich Pflanzen­wissenschaften / Transkriptom­analysen (w/m/d)

Nutzpflanzen sind dem Einfluss des Klimawandels stark ausgesetzt. Die damit verbundenen extremen Temperaturen und auch Trockenheit können den Ertrag und auch die Qualität von Nutzpflanzen negativ beeinflussen.

Sie untersuchen die Trocken­toleranz von alten Nutzpflanzen und den Einfluss von Trocken­stress auf die Genexpression mit besonderem Fokus auf Biosynthesewege von sekundären Pflanzen­inhalts­stoffen (Flavonoide). Ihre Aufgaben beinhalten die Anwendung kontrollierter Stress­behandlungen, Phänotypisierung von Stress­reaktionen mit verschiedenen Sensoren und Genexpressions­studien in Real-Time-PCR sowie RNA-Sequenzierungen und Transkriptom­analysen mit entsprechenden bioinformatischen Auswertungen.

Sie dokumentieren Ihre Arbeit und analysieren und interpretieren die erhaltenen Messwerte im wissen­schaftlichen Kontext. Sie präsentieren Ihre Ergebnisse auf Projekt­treffen sowie nationalen und inter­nationalen Konferenzen und publizieren Ihre Ergebnisse in wissen­schaftlichen Fach­zeit­schriften. Abschließend werden Sie die erlangten Ergebnisse und Publikationen zu Ihrer Doktorarbeit zusammen­fassen.

• Ein mindestens mit der Gesamtnote „gut“ abgeschlossenes wissen­schaftliches Hochschul­studium im Bereich Biologie, Gartenbau oder Land­wirtschaft
• Kenntnisse und Erfahrung in der Anzucht von Pflanzen auf Substrat sowie unter Trocken­stress
• Kenntnisse und Erfahrung in der Phänotypisierung von Pflanzen
• Praktische Erfahrung in der Arbeit mit RNA (RNA-Extraktion, RT-PCR, RNA-Sequenzierung)
• Kenntnisse in Programmier­sprachen wie R oder Python zur Daten­verarbeitung und -analyse
• Erfahrung in der Quantifizierung von Pflanzen­inhalts­stoffen mit LC-MS
• Hohes Maß an Selbst­ständig­keit
• Bereitschaft zu großem Engagement
• Sehr zuverlässiger und gewissen­hafter Arbeits­stil
• Gute Kommunikationsfähigkeit zum Austausch mit Kolleg:innen und Kooperations­partner:innen
• Ausgeprägte Teamfähigkeit sowie die Fähigkeit zur kooperativen Zusammen­arbeit

Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzu­gestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch:

• Eine hoch motivierte Arbeitsgruppe sowie ein inter­nationales und inter­disziplinäres Arbeitsumfeld in einer der größten Forschungs­einrichtungen in Europa
• Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z. B. im Homeoffice
• Hervorragende wissen­schaftliche und technische Infrastruktur
• Möglichkeit zur Teilnahme an (inter­nationalen) Konferenzen und Projekt­treffen
• Kontinuierliche fachliche Betreuung durch Ihre:n wissen­schaftliche:n Betreuer:in
• 30 Tage Urlaub und eine Regelung für freie Brückentage (z. B. zwischen Weihnachten und Neujahr)
• Weiterentwicklung Ihrer persönlichen Stärken, z. B. durch ein umfangreiches Trainings­angebot; ein strukturiertes Programm mit Weiter­bildungs- und Vernetzungs­angeboten speziell für Promovierende über JuDocS, das Jülich Center for Doctoral Researchers and Supervisors: go.fzj.de/JuDocs

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: go.fzj.de/Benefits.

Die Position ist zunächst auf drei Jahre befristet mit der Möglichkeit einer länger­fristigen Perspektive. Die Vergütung erfolgt analog der Entgelt­gruppe 13 (65 %) des Tarif­vertrags für den öffentlichen Dienst (TVöD-Bund) zuzüglich 60 % eines Monatsgehaltes als Sonder­zahlung („Weihnachts­geld“). Die monatlichen Entgelte in Euro entnehmen Sie bitte der Seite 66 des PDF-Downloads: go.fzj.de/bmi.tvoed.

Informationen zur Promotion im Forschungs­zentrum Jülich inklusive der Standorte finden Sie hier: go.fzj.de/Promotion.